SimVector(质粒图谱绘制工具)

　　SimVector是一款质粒图谱绘制工具，支持绘制各种图案、颜色、字体和类型的圆形和线性矢量地图，还拥有多种绘图工具，方便用户使用，有需要可以下载。

功能介绍

　　一、计划克隆实验

　　1、设计网关克隆实验：使用SimVector，您可以执行构成 Gateway?克隆的BP和LR反应。供体载体和表达载体是BP反应和产生进入克隆所必需的。LR反应和生成表达载体需要入口载体和目标载体。

　　2、设计TA克隆载体：SimVector可以轻松设计 TA克隆实验。TA克隆向导接受商业T载体或限制性设计的T载体，并将其与经修饰的PCR产物组合。然后，您可以生成高度准确的重组DNA质粒图谱。

　　3、进行限制性克隆：克隆技术需要限制性酶切割载体分子和待克隆的分子。SimVector执行限制酶分析，并允许您对所需序列上的限制酶进行过滤，注释和映射。

　　4、执行限制分析：使用超过1000种限制酶的综合数据库进行限制性分析。SimVector识别DNA序列中的限制酶识别位点，用于测定限制酶。提供两种酶过滤模式来指定限制性分析的参数。酶过滤使您能够设置酶标准以符合您的实验要求。为方便起见，包括来自20多家商业供应商的酶套。

　　二、绘制目录质量质粒图

　　1、绘制质粒图：用SimVector绘制出版质量质粒图。

　　2、多重克隆站点(MCS)显示：SimVector通过解释GenBank头文件注释(可用)来识别MCS，或者您可以手动指定。

　　3、支架视图显示：它甚至有聪明的只列出在MCS内切割的酶和其他地方。这种特殊格式我们称之为“括号视图”。

　　4、目录质量矢量图形： SimVector生成矢量图形格式的质粒图，用于导出到adobe Illustrator 10和Microsoft PowerPoint 2002。

　　5、导出网络就绪图像：以JPEG，PNG和TIF格式导出高分辨率质粒图，便于网站添加，导出图像可以进行主机页面。

　　6、图形Entrez特性：将GenBank注释转换为图形特征(线性和圆形序列图)。

　　7、创建向量：创建向量图，而不知道其序列。

　　三、自定义矢量地图

　　1、简单样式：从数百种字体，颜色，样式和限制酶和功能的填充模式中选择一个按钮。

　　2、颜色主题：定义您自己的自定义颜色主题并重复应用。

　　3、选框选择：组选择对象以快速设置所有样式。

　　4、线性和圆形视图：显示圆形和线性质粒图。

　　5、缩放：放大查看详细图形或进行概览。

　　6、文本：添加文本以注释质粒图。

软件特色

　　1、绘制卓越的出版质量质粒图

　　无论您是销售工程质粒的目录公司还是对重组克隆实验进行限制性分析，SimVector将帮助您模拟实验，并从头至尾创建出版质量质粒图。使用软件绘制各种颜色，图案，字体和线条类型的圆形和线性质粒图。以斜体显示细菌部分的两种字体样式显示酶名称，如传统的。在质粒图中包含特征注释的任何位置，在单个文本字中使用多种字体样式和颜色。

　　2、多重克隆站点

　　矢量目录通常以独特的格式显示MCS，其中酶在垂直列表中一个上。SimVector通过解释GenBank标题注释来识别MCS，或者您可以手动指定它们。然后，它们以我们称为“括号视图”的特殊格式绘制。它甚至有聪明的人只列出在MCS和其他地方切割的酶。

　　3、闪电快速克隆模拟

　　SimVector将GenBank或??本地文件的序列标题中的注释转换为完全说明的地图。克隆向导可以引导您完成流行的重组方案，例如Gateway克隆和TA克隆，以及一个和两个酶限制性克隆。ORF搜索可以帮助您确保构造保留在框架内。点击一个按钮，您可以翻译表达蛋白质的序列，以检查可能的阅读框错误。使用SimVector，克隆模拟就像点击几个按钮一样简单。

　　4、限制分析

　　SimVector具有全面的限制酶分析功能。从一千多种限制性酶的数据库中选择，或者使用我们预先加载的普遍的商业酶库。SimVector还使您可以构建自己的定制酶组。

　　5、生物学家设计的直观界面

　　SimVector具有直观的生物学家设计的界面，可进行限制性克隆和序列分析。点击向导使得即使对于初学者也很容易使用，而多功能功能可以完全控制专家绘制质粒图。